对于软组织损伤的病因，病理机制，多年来，国内外很多专家，学者作了不懈的努力，许多学者根据自己的研究成果，提出了多种关于该类疾病的病因，病理学说。例如：无菌性炎症学说，痹症学说，闸门学说，筋出槽学说，筋膜间室综合症学说。骨性纤维管卡压综合症学说等等。各种学说都各有特色，它们分别从各种不同角度反映了该类疾病的宏观病理变化，并对慢性软组织损伤这一类骨伤科疑难病症的临床治疗起到积极指导作用。
动态平衡是软组织损伤的第一位主要病理机制。粘连、疤痕和挛缩是慢性软组织的致病因素，影响机体功能，这些病理改变遗留下来后，而成为新的致病因素，影响机体的正常功能，并产生疼痛等症状：应该和大家说的是：并不是所有的粘连、疤痕、挛缩存在的地方都会出现临床症状。根据临床观察，这三点病理因素，在人体机能活动较强，肌肉运动幅度较大的地方，容易出现临床症状，且病灶点大都在肌肉有起止点处，四肢、躯干的关节周围。
无论是外伤性损伤、劳损、情志所伤或疾病性软组织损伤，其造成软组织病理改变的结果是组织变性。具体表现为增生、粘连、或挛缩等。各种急慢性损伤（包括积累性损伤和隐蔽性损伤）及理化因素（包括风寒湿邪侵袭）作用于人体，必然产生生物物理学和生物化学的变化，引起机体局部散在出血，毛细血管痉挛，使局部组织内缺血缺氧、无菌性炎症物质缓激肽（5－羟色胺、儿茶酚胺）等渗出，代谢产物与胶原纤维物质堆积，局部组织内发生充血、水肿、刺激压迫局部神经末梢引起疼痛。进而出现肌痉挛、肌挛缩，以致血管、神经受到挤压加重，使局部更加的缺血，出现血性肌痛，型成恶性循环；另外因损伤致使软组织之间、骨骼之间的力学状态也发生改变，活动时力学的动态平衡，同时，因损伤后肌紧张或肌挛缩，致使相应关节的力平衡失调，而发生关节不同程度的移位，因紧张或松弛的软组织，致使关节维持在移位的状态，同样也对周围的神经血管产生刺激或挤压等。
以上这些生物物理学和生物化学的变化作用于人体的信息反应系统，通过人体的神经反射系统和体液调节系统的作用，机体开始自我修复，同时被破坏的组织生理功能也被恢复。但是在此修补的过程中，由于病变部位有关组织血管的自我保护机制，使之处于警觉状态。而制动，加之其它一些因素的影响和作用，例如缺乏足够活动和煅练，其病变区域的软组织，也型成了粘连，疤痕或挛缩，成为新的致病因素，引起功能障碍。
静态张力学说
所谓静态张力学是指骨骼肌在剧烈运动之后，处于静止状态，肌肉纤维仍处于一种紧张痉挛收缩状态，或由于机体体位不正，使骨骼肌处于静态失衡或由于骨骼肌内发生无菌性炎症。如滑囊炎、囊腔积液，至使内在张力过高，内压过大所致，机体静态所引起的静力性损伤。在时代发展过速，工作节奏过快，机体静态牵张失衡的劳动（即脑力劳动者）易患静力性肌损伤。如储纳员、打字员、机关干部、青年学生等等，都易患颈部静力性肌损伤——颈型颈椎病。
筋骨针的松解作用机制
各种原因的软组织损伤（外因、风湿与类风湿）直接作用和慢性劳损，理化因素引起肌肉纤维、肌腱、肌筋膜、腱鞘、滑囊、韧带及血管、神经等软组织撕裂出血，人体在修复过程中，由于充血、水肿、渗出、纤维组织增生，最后型成结疤粘连。
由于粘连致使骨关节周围的肌肉、筋膜、韧带变性，原有位置和运动的方向发生改变，破坏了原有的动静态平衡，引起疼痛和功能障碍。
筋骨针同其它针刀一样能起到闭合性手术效应。筋骨针在软组织损伤的病灶区即结疤、粘连，或无菌性炎症部位松解、剥离粘连、解除了局部血管、神经的卡压症状，即通道减压作用，改善了病变部位的微循环，恢复了局部组织内力的平衡。
筋骨针同时能够在肌纤维、肌筋膜间室和肌肉起止点的炎性粘连处，切开粘连、松解肌肉。
能切开筋膜间室或滑囊、囊肿直接抽取囊腔内容物起到减张减压、引流作用，减轻了局部组织内的压力和静态张力。
松解骨神经纤维管的卡压症状，从而恢复了局部组织内的生物力学平衡。
筋骨针药物埋线的作用机制
对于一些反复发作的疾病，如胃溃疡、胃下垂、结肠炎、小儿疝气、癫痫病、男性性功能障碍、女性月经不调等疑难杂症疾病的治疗，在背部九大系统疾病相关诊治区用筋骨针在注药、松解的同时，可留植医用药线——药物浸泡过的羊肠线。一方面可发挥药物对疾病的药物效应；另一方面羊肠线为一种异体蛋白，当埋入穴位之后，经过分解吸收，对机体产生一种强而支持久的生物化学刺激，通过这样一种机械、物理、化学的双重作用，来调动机体本身固有的调节机能。这种刺激是非特异性的刺激，它可以使人体免疫功能得到调整与提高，更进一步调整病理状态下的机体平衡内环境的平衡失调。药物线疗详细作用机制见于《筋骨针药线疗法》书。
针刺疗效
应用筋骨针在病灶区，即肌肉起止点、交叉点或骨端附着点、相邻点、骨性隆突点等病变阳性敏感点（压痛点、酸胀点、结节点）敏感区域点进行松解剥离，达到“不通则痛，以松治痛”的目的。中医的“以痛为腧”即阿是穴，筋骨针刺入病灶点下的皮肤筋膜、骨膜面时患者感酸胀沉痛。这种感觉即中医针感“得气”方可注药注氧行针，即可起到疏通经络经脉，行气活血，调节阴阳，从而达到使机体内在阴阳平衡恢复作用。
这种对穴位长久持续的机械物理化学的刺激，可通过经络而起到较长时间的针刺效应。这种刺激可大大激发全身之经气、精气，使全身气体运动加速，从而调节身体有关脏腑器官活动，使经络保持在平衡及旺盛的功能状态，以达到治疗疾病之目的，起到长期的针刺效应。